Growth curve of female collared peccaries (Pecari tajacu) raised in captivity in the Brazilian Amazon Region / Curva de crescimento de fêmeas cateto (Pecari tajacu) criados em cativeiro na Amazônia Brasileira

This work aims to determine the most suitable nonlinear model to describe the growth of female collared peccaries (Pecari tajacu). The monthly records of the weight of 10 captive female collared peccaries over a period of two years in the Brazilian Amazon Region were used. The growth models used were the Von Bertalanffy, Brody, Gompertz and Logistic. The parameters were estimated by using the NLIN procedure from the SAS application. The criteria used to verify the adjustment of the models were: asymptotic standard deviation (ASD); coefficient of determination (R²); average absolute residual deviation (ARD) and the asymptotic rate (AR). The Brody model and the Logistic model estimated the highest (19.44kg) and the lowest (19.18kg) asymptotic weight (A), indicating the lowest (0.0070kg/day) and the highest (0.0121kg/day) maturation rate (K). These results and the coefficients of phenotypic correlation that varied from -0.75 and -0.47 confirmed the antagonistic nature between these parameters. The Brody model estimated the lower value for ARD, a limiting factor for describing the lowest value for AR through this model. The Brody model showed the best adjustment for AR, although the other models also showed a suitable adjustment to the weight data of said species/gender. Based on the AR obtained in this work, the Brody model is recommended for adjusting the growth curve of the female collared peccaries. Depending on the estimated values, especially for K, this trait can be included in a selection index.

Com o objetivo de ajustar modelos não-lineares, foram utilizados registros mensais do peso de 10 fêmeas de cateto (Pecari tajacu) coletados durante dois anos, no criatório do campo experimental Álvaro Adolfo da Embrapa Amazônia Oriental, Belém, PA. Utilizaram-se os modelos de Von Bertalanffy, Brody, Gompertz e Logístico. Os parâmetros foram estimados usando o procedimento NLIN do aplicativo SAS. Os critérios utilizados para verificar o ajuste dos modelos foram: desvio padrão assintótico (ASD); coeficiente de determinação (R²); desvio médio absoluto dos resíduos (ARD) e o índice assintótico (AR). Os modelos Brody e Logístico estimaram, respectivamente, o maior (19,44kg) e o menor (19,18kg) peso assintótico (A), caracterizando a menor (0,0064kg/dia) e a maior (0,0113kg/dia) taxa de maturação (K), haja vista a natureza antagônica entre estes parâmetros, comprovada pela correlação fenotípica variando entre -0,75 à -0,47. O modelo Brody estimou o menor valor para o ARD, fator limitante para caracterizar o menor valor para o AR por este modelo. Considerando o AR, o modelo Brody apresentou o melhor ajuste, contudo, pelos valores encontrados, os demais modelos também apresentaram ajuste adequando aos dados ponderais da referida espécie/sexo. Com base no AR adotado neste trabalho, recomenda-se o modelo Brody para ajustar a curva de crescimento de fêmeas de cateto (Pecari tajacu). Em razão dos valores estimados, sobretudo, para a K, essa característica pode ser incluída em um índice de seleção. Contudo, estudos com grupos mais representativos e criados em outras condições se faz oportuno.

Índices de eficiência reprodutiva de búfalos da Amazônia Oriental do Brasil / Indices of reproductive efficiency of buffaloes of the Brazilian Eastern Amazon

Foram avaliados registros de manejo reprodutivo de búfalos das raças Jafarabadi, Murrah, Mediterrâneo, Carabao e Tipo Baio, bem como seus mestiços, no período de 1983 a 2005. Estudaram-se as características reprodutivas: idade à primeira cria (média de 1052,52±120,45 dias), intervalo de partos (média de 399,69±23,78 dias), eficiência reprodutiva (média de 91,09±1,89%), fertilidade real adaptada (média de 29,30±4,40 quilogramas de bezerro parido por ano), produtividade ao primeiro parto adaptada (média de 33,75±6,89 quilogramas) e produtividade acumulada adaptada (média de 22,86±6,55 quilogramas de bezerro parido por ano). Foram verificadas influências do ano de parto e o grau de sangue da fêmea sobre as características estudadas, o que indica que tais efeitos devem ser incluídos na avaliação genética e na seleção dos animais. Os índices produtivos utilizados mostraram-se de grande valia para a seleção, devendo ser mais estudadas suas interações relativas ao desempenho geral do rebanho.

We evaluated records of reproductive management Jaffarabadi buffalo breeds, Murrah, Mediterranean, Carabao and Baio types, and their crosses, in the period from 1983 to 2005. We studied the following reproductive characteristics: Age at first calving (mean 1052.52±120.45 days), calving interval (399.69±23.78 mean days), Reproductive Efficiency (average 91.09±1, 89%), Real Adapted Fertility (average 29.30±4.40kg calf calved each year), the First Labor Productivity Adapted (mean 33.75±6.89kg) and Accumulated Productivity Adapted (mean 22.86±6.55kg calf calved each year). Influences were observed in the year of delivery and degree of blood on the female traits, suggesting that such effects should be included in genetic evaluation and selection of animals. The production indices used were of great value for the selection, and should be well studied for their interactions with the overall performance of the herd.

Relação entre polimorfismo do gene do hormônio do crescimento e características de precocidade em novilhas da raça Nelore / Relationship between polymorphism of growth hormone and precocity traits in Nellore heifers

Avaliaram-se as relações entre o polimorfismo do gene do hormônio do crescimento (GH) e as características de precocidade, em novilhas da raça Nelore. Amostras de sangue periférico foram obtidas de 181 animais de três rebanhos distintos do estado da Bahia, nas quais foi realizada a extração de DNA e a amplificação por PCR, seguidas por digestão com enzima de restrição AluI. Os fragmentos resultantes da digestão enzimática foram analisados em gel de agarose 2 por cento para determinação dos respectivos genótipos. A frequência do alelo Leu nas amostras analisadas foi estimada em 100 por cento. Em decorrência da alta incidência de homozigose para o alelo Leu, sugere-se que o restriction fragment lenght polymorphism AluI do gene GH não possa ser considerado como marcador molecular para precocidade sexual em novilhas Nelore nesses rebanhos.

The relationships between polymorphism of growth hormone gene (GH) and precocity traits in Nellore heifers were evaluated. A total of 181 animals from three different farms of Bahia state, Brazil, were blood sampled. The DNA of each animal was extracted, amplified by PCR, and digested by "AluI" restriction enzyme, and the resultant fragments were analyzed in 2 percent agarose gel for genotype identification. The frequency of Leu allele in the analyzed samples was estimated in 100 percent. Due to the high incidence of homozygose for the Leu allele, it is suggested that the restriction fragment lenght polymorphism AluI of GH gene can not be considered as a molecular marker for sexual precocity in Nellore heifers of those herds.

Variabilidade genética de búfalos em rebanho-núcleo com base na análise de pedigree / Genetic variability in water buffalo from nucleous herd by pedigree analysis

Parâmetros baseados na probabilidade de origem do gene foram usados para descrever a variabilidade em uma população de búfalos da Embrapa Amazônia Oriental. A magnitude dos resultados foi de média a baixa (por volta de 20 animais), sugerindo que poucos fundadores contribuiriam para a formação da população. Dentre os 20 ancestrais que mais aportam genes aos machos - representando ao todo 71 por cento dos alelos -, 39 por cento, 26 por cento e 5 por cento, respectivamente, são as contribuições marginais das raças Murrah e Mediterrâneo e seus mestiços. Para as fêmeas, em que os 20 ancestrais aportam 67,5 por cento dos genes, 42 por cento e 26 por cento, respectivamente, são as contribuições marginais das raças Murrah e Mediterrâneo.

Parameters based on the probability of gene origin were used to describe genetic variability in a buffalo population from the Embrapa Amazônia Oriental, Belém, Pará, Brazil. The parameters generated medium to low values (around 20 animals) and suggested low founder representativeness. From the 20 ancestors that gave more genes to males (with 71 percent of alleles), genetic contributions were 39 percent, 26 percent, and 5 percent, respectively, for Murrah, Mediterraneo, and crossbreds. For females, these values were 42 percent and 26 percent for Murrah and Mediterraneo breeds.

Contribuição dos efeitos de genearcas e de famílias sobre a probabilidade de permanência em rebanhos da raça Nelore / Breeders and family effects in stayability in Nellore herds

Foram preditas diferenças esperadas na progênie para probabilidade de permanência no rebanho (stayability) de 4180 touros com filhas na base de dados do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore, utilizando-se modelo de limiar unicaráter de touro-avô materno, sob metodologia bayesiana. Os touros foram classificados em ordem decrescente e aqueles com diferenças esperadas na progênie acima de 57,6 por cento, considerados como TOP1 por cento, foram analisados quanto à genealogia visando avaliar a existência de efeito de família, bem como a contribuição dos genearcas e ancestrais da raça Nelore para a característica considerada. Os principais fundadores, que juntos somaram 18,8 por cento dos genes presentes nos touros TOP1 por cento, foram Karvadi IMP (com 8,2 por cento dos genes, essencialmente via seu filho Chummak), Godhavari IMP (com 6 por cento de contribuição, via Kurupathy e Neófito), Rastã IMP e Falo da BV (2,5 e 2,1 por cento, respectivamente, via materna, pois não apresentaram parentesco com touros ancestrais). O touro Rolex, da variedade mocha, esteve presente em 12 linhas (maternas ou paternas), via seu neto Cardeal. Dos sete ancestrais da raça Nelore com maiores contribuições genéticas (que somaram 15,3 por cento dos genes), cinco foram da variedade mocha. Somente 28 animais aportaram 50 por cento da variabilidade genética, evidenciando o baixo número de animais utilizados como reprodutores na raça Nelore

Expected progeny differences (EPD) for stayability were estimated for 4,180 sires with daughters in the Program for Genetic Improvement of the Nellore Breed. The univariate threshold sire-maternal grandsire model was used, following a Bayesian methodology. The sires were ranked for stayability in descending order, and those whose EPD were higher than 57.6 percent were regarded as TOP1 percent. Pedigree analysis was then conducted in order to establish whether a family tendency was present, as well as the contribution of Nellore founders and ancestors for the trait under consideration. The main founders, which together were responsible for 18.8 percent of the genes in TOP1 percent sires, were Karvadi IMP (with 8.2 percent of genes, basically through its son Chummak), Godhavari IMP (with 6 percent of genes, through Kurupathy and Neofito), Rastã IMP and Falo da BV (respectively with 2.5 percent and 2.1 percent, through mothers, since they are not related to the ancestor sires). Rolex, a polled sire, stayed in twelve lineages - paternal or maternal - through its grandson Cardeal. Among the seven Nellore ancestors with the highest genetic contributions (15.3 percent of genes when put together), five were of the polled variety. Only 28 animals apportioned 50 percent of the total genetic variability, which is indicative of the small number of animals used as Nellore reproducers

Pedigree analyses in the Breeding Program for Nellore Cattle

Parameters based on the probability of gene origin were used to describe genetic variability in three reproductive groups from the Breeding Program for Nellore Cattle (PMGRN). The three reproductive populations (cows in reproductive age, bulls from artificial insemination centers and young bulls in progeny test) generated medium to low values. The effective number of founders (Nf ), the effective number of ancestors (Na) and the remaining genomes (Ng) suggest low founder representativeness, high genetic contribution by some ancestors, considerable loss of founder alleles and lack of allelic representativeness in bulls kept in artificial insemination centers and young sires in progeny test in relation to the diversity on the farms participating in the PMGRN. The parameters based on the probability of gene origin in the three reproductive groups were: 84.3, 53 and 54.2 (Nf ); 71, 36.6 and 30 (Na) and 51.4, 19.3 and 19 (Ng) for cows, bulls from artificial insemination centers and young sires in progeny test, respectively. Future matings and the introduction of selected progeny reproduction may decrease the parameters based on the probability of gene origin in each reproductive group, thereby increasing considerably the additive relationship in the three reproductive groups and consequently increasing the probability of inbreeding in the future. Strategies to maintain genetic variability in bull populations must be implemented.

Parâmetros genéticos da taxa de maturacão e do peso assintótico de fêmeas da raca Nelore / Genetic parameters of maturation rate and asymptotic weight of Nelore females

Utilizaram-se 14.563 pesagens de 1158 fêmeas da raca Nelore, nascidas entre 1984 e 1995, pertencentes a 10 fazendas, distribuídas em sete estados do Brasil. Com o objetivo de estabelecer um padrão médio de crescimento, obter parâmetros individuais das curvas e estimar os componentes de variância, herdabilidade e correlacões genéticas dos parâmetros das curvas, foram comparados os modelos de Von Bertalanffy, Brody, logístico e Gompertz. Foram utilizados o procedimento NLIN e o programa MTDFREML sob modelo animal em análise unicaráter e bicaráter. Os parâmetros médios dos pesos assintóticos (A) e das taxas de maturidade (K) foram: 515,06 e 0,071 para Von Bertalanffy; 552,77 e 0,045 para Brody; 501,11 e 0,097 para logístico, e 507,00 e 0,083 para Gompertz, respectivamente. As estimativas de herdabilidade para A e K foram de alta magnitude: 0,39 e 0,42 para Von Bertalanffy, 0,42 e 0,44 para Brody, 0,40 e 0,41 para logístico e 0,39 e 0,39 para Gompertz, respectivamente. As correlacões genéticas variaram entre -0,69 e -0,49. Todos os modelos foram adequados para descrever o crescimento. A ordem de escolha do melhor modelo para descrever a curva de crescimento foi: Brody, Von Bertalanffy, logístico e Gompertz. Essas características seriam passíveis de inclusão em índice de selecão para selecão de fêmeas Nelore.

Comparação entre análises para permanência no rebanho de vacas Nelore utilizando modelo linear e modelo de limiar / Threshold versus linear model analyses in stayability for Nellore cows

Foram obtidas estimativas de herdabilidade e preditas diferenças esperadas na progênie para probabilidade de permanência no rebanho (stayability) de 4180 touros com filhas na base de dados do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore. Modelo de limiar e modelo linear foram utilizados sob análise Bayesiana via software multiple-trait Gibbs sampler for animal models. A implementação adotada considerou tamanho de cadeia de Gibbs de 225 mil, período de descarte amostral de 25 mil e tomada de amostra a cada mil rodadas. As estimativas de herdabilidade foram de menor magnitude para o modelo linear, 0,065, contra 0,158 sob modelo de limiar. Quando transformadas para escala normal subjacente, o valor obtido ficou em 0,13±0,05, bem próximo àquele encontrado sob modelo de limiar. A correlação entre classificações foi de 97 por cento. O modelo de análise considerado para stayability, sob enfoque bayesiano, parece não influenciar a classificação dos animais quanto aos valores genéticos preditos. Análises sob modelo linear, com reduzido tempo de processamento, poderiam ser preferidas bastando transformar a escala da característica para obter a estimativa de herdabilidade.

Estudo de modelo alternativo para estimaçäo de componentes de (co)variância e prediçäo de valores genéticos de características de crescimento em bovinos da raça Nelore / Alternative model to estimate (co)variance components and to predict breeding values for growth traits in Nelore cattle

Foram obtidas estimativas de parâmetros genéticos e preditas DEP's (diferença esperada na progênie) para pesos näo-padronizados aos 120 dias de idade (PR120), à desmama (PR240), ao ano de idade (PR365), aos 15 meses (PR455) e ao sobreano (PR550), de 29.769 animais Nelore, adotando-se o método REML, sob modelo animal. Para características PR120, PR240, PR365 e PR455, o modelo completo incluiu efeitos aleatórios de animal, aditivo materno, de ambiente permanente da vaca e de resíduo, efeitos fixos de grupo de contemporâneos (GC) aos 120 dias de idade, ou à desmama, classe de idade da vaca ao parto (CIVP), e como covariável a idade do animal à época da pesagem. Para características pós-desmama (PR365, PR455 e PR550), consideraram-se dois modelos de análise: um sem efeito permanente da vaca, com efeitos aleatórios de animal, aditivo materno e de resíduo, efeitos fixos de GC ao ano de idade, aos 15 meses ou ao sobreano e CIVP, e como covariável a idade do animal à época da pesagem, e outro com efeitos aleatórios de animal e de resíduo, efeitos fixos de GC ao ano de idade, aos 15 meses ou ao sobreano e CIVP, e como covariável a idade do animal à época da pesagem. As médias observadasñdesvios-padrao foram 127+25kg (PR120); 191ñ34kg (PR240); 225ñ42kg (PR365); 266ñ51kg (PR455) e 310ñ56kg (PR550). Resultantes das análises de característica única sob modelo completo, as estimativas de herdabilidade direta e materna para PR120, PR240, PR365 e PR455 foram 0,23 e 0,08; 0,19 e 0,10; 0,24 e 0,04; 0,30 e 0,04, respectivamente. As estimativas de herdabilidade direta foram 0,39; 0,44 e 0,43, respectivamente, para PR365, PR455 e PR550. A partir do modelo sem efeito de ambiente permanente, as estimativas de herdabilidade direta e materna foram, respectivamente para PR365, PR455 e PR550, 0,25 e 0,08; 0,32 e 0,07; 0,38 e 0,03. Quando comparadas às estimativas de herdabilidade das características padronizadas, houve pouca diferença em magnitude entre elas. Importante mudança de posto ocorreu entre a característica padronizada e a nao padronizada, principalmente para DEP materna

Análise de alguns critérios de seleçäo para características de crescimento na raça Nelore / Analysis of some selection criteria for growth traits in Nellore cattle

Foram obtidas estimativas de parâmetros genéticos para peso ao nascimento (PN) e ao sobreano (PSOB), ganhos de peso pré-(GPNDES) e pós-desmama (GP345), dias para 160 (D160) e 300kg (D300) de peso vivo, e taxas de crescimento relativo pré-(TCR1) e pós-desmama (TCR2), utilizando 60.470 animais Nelore. Adotou-se o método REML, sob modelo animal. Para características pré-desmama (PN, GPNDES, D160 e TCR1), o modelo incluiu efeitos aleatórios de animal, aditivo materno, de ambiente permanente de vaca e de resíduo, e os efeitos fixos de grupo de contemporâneos (GC) à desmama e das covariáveis idade da vaca ao parto e idade do animal (IA) à época da desmama. Para características pós-desmama (PSOB, GP345, D300 e TCR2), considerou-se como efeito fixo o GC ao sobreano e como covariável a IA ao sobreano. As médias observadasñdesvios-padräo foram 30,7ñ3,8kg (PN); 317,2ñ49,4kg (PSOB); 155,4ñ21,0kg (GPNDES); 119,6ñ32,2kg (GP345); 175,7ñ34,2 dias (D160); 553,9ñ152,7 dias (D300); 913,2ñ80,9x10 menos elevado a terceira potência por cento/dia (TCR1); e 140,5ñ31,2x10 menos elevado a terceira potência por cento/dia (TCR2). Resultantes das análises conjuntas de duas características (GPNDES) e cada uma das outras características), as estimativas de herdabilidade direta e materna para GPNDES variaram, respectivamente, de 0,11 a 0,20 e de 0,03 a 0,16. Os coeficientes de herdabilidade direta foram 0,24; 0,26; 0,18; 0,15; 0,12; 0,14; e 0,22, respectivamente, para PN, PSOB, GP345, D160, D300, TCR1 e TCR2. Os coeficientes de herdabilidade materna para PN, D160 e TCR1 foram, respectivamente, 0,11; 0,00 e 0,14. As correlaçöes genéticas entre GPNDES e as outras características foram altas, exceto entre GPNDES e GP345 (0,23)

Fatores de ajuste de peso à desmama segundo a idade da vaca ao parto, em bovinos da raça Nelore / Adjustment factors for weaning weight according to age of dam in Nellore cattle in Brazil

Estimaram-se os fatores de ajuste, aditivos e multiplicativos, por duas metodologia diferentes, quadrados-mínimos e modelos mistos (modelo animal), em 239.511 registros de animais da raça Nelore, criados em pasto nos Estados de Säo Paulo, Mato Grosso do Sul e Goiás. O modelo matemático para a análise de peso à desmama (PD), por quadrados-mínimos, incluiu uma média geral, o grupo de contemporâneos à desmama (GC), a classe de idade da mäe ao parto (CIV) e a idade à desmama (IDDES), como covariável linear e quadrática. Para o peso à desmama ajustado para 205 dias de idade (P205), o modelo incluiu o GC, e CIV e o erro aleatório. As análises por modelo animal, tanto para PD quanto para P205, incluíram os efeitos fixos (GC e CIV), os efeitos genéticos direto e materno do animal e os efeitos permanentes de ambiente (mäe) e o erro residual (sendo à IDDES covariável linear e quadrática de PD). Os resultados confirmam a necessidade de obtençäo de fatores de ajuste para idade da mäe ao parto, calculados separadamente para cada sexo e regiäo. Os fatores de ajuste aditivos e multiplicativos foram muito semelhantes para ambas as metodologias empregadas